Com trabalhos também como roteirista, se destacou como descobridor de atores e produtor de filmes clássicos que driblaram a censura da ditadura franquista. Querejeta foi responsável pela "A Caça" (1966) e "Cría cuervos" (1976), de Carlos Saura, assim como de "O Espírito da Colmeia" de Víctor Erice (1973).
Um detalhe curioso de Querejeta é que ele teve uma carreira como jogador de futebol com relativo sucesso nos anos 1950. Jogou pelo Real Sociedad e marcou cinco gols na primeira divisão espanholha. Com os rendimentos de jogador é que criou sua produtora cinematográfica. "A importância de Elías Querejeta para o cinema espanhol é difícil de exagerar", relatou o ministro espanhol da Cultura, José Ignacio Wert.