Ainda pelo Vasco, o meia foi flagrado no exame antidoping no dia 2 de março de 2013, após a partida contra o Fluminense válida pelas semifinais da Taça Guanabara. Foram encontradas as substâncias probidas Hidroclorotiazida e Carboxi-Tamoxifeno.
A advogada do atleta, Luciana Lopes, entrou com recurso no CAS contra a CBF e a Fifa depois que o jogador foi condenado em agosto pelo Superior Tribunal de Justiça Desportiva (STJD) a uma pena que iria até maio do ano que vem. A CBF comunicou que não tinha interesse no processo, já a Fifa entendeu que não houve nenhuma violação por parte do jogador.
Desde 2 de agosto de 2013, quando seu contrato com o Vasco encerrou, Carlos Alberto está sem clube. O meia, que atuou no Grêmio em 2011, chegou a treinar por algum tempo no Bangu e agora realiza exercícios em uma academia para manter a forma.
