Zé Roberto foi destaque da Seleção Brasileira, na Copa do Mundo de 2006. Naquele time fortemente criticado, foi um dos nomes mais elogiados do grupo treinador por Carlos Alberto Parreira. Agora, já na reta final da carreira, chegará como nome experiente e internacional para melhorar o setor de criação tricolor.
José Roberto da Silva Júnior foi revelado para o futebol na Portuguesa, na qual foi vice-campeão brasileiro em 1996. Perdeu o título justamente para a última geração recheada de troféus do Tricolor, com Paulo Nunes, Jardel e companhia.
Foi vendido ao Real Madrid e teve uma breve passagem pelo Flamengo, antes de embarcar para o futebol alemão. Após nove anos de títulos e mais de 280 jogos disputados, por Bayer Leverkusen e Bayern de Munique, retornou ao Brasil em 2006, por empréstimo ao Santos.
Em 2007 mostrou, apesar dos 33 anos, um grande futebol, exatamente sob a orientação do técnico Vanderlei Luxemburgo. No começo daquele ano foi considerado um dos melhores jogadores no futebol brasileiro. E o Grêmio voltou a cruzar o caminho de Zé Roberto.
Na semifinal da Libertadores daquele ano, o Tricolor Gaúcho venceu a primeira partida no Olímpico por 2 a 0 e foi para a Vila Belmiro segurar a vantagem. Zé Roberto teve grande atuação e marcou o terceiro gol da equipe santista, mas Diego Souza já tinha marcado 1 e o saldo qualificado garantiu o Grêmio na final.
Vestiu a amarelinha na Copa do Mundo de 2006 e foi considerado um dos destaques do time que não empolgou na competição. Apesar das boas avaliações, foi eliminado da competição pela França, junto com os demais comandados de Parreira, nas quartas de final.