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O primeiro duelo diante de clubes equatorianos ocorreu em 1977, na segunda Libertadores do Inter. Naquela edição, o time vermelho enfrentou o El Nacional e o Deportivo Cuenca. Na partida de estreia, os gaúchos venceram o Deportivo por 2 a 0. Na rodada seguinte, o El Nacional era o adversário e venceu o confronto por 2 a 0.
Depois de atuar fora de casa, o Inter recebeu os dois equatorianos no Beira-Rio. Nos dois compromissos, o Colorado conquistou seis pontos. O Deportivo Cuenca foi derrotado por 3 a 1 e o El Nacional perdeu por 2 a 0.
Em 2006, ano da primeira conquista na Libertadores, o Inter vinha de uma classificação sofrida contra o Nacional, nas oitavas de final. Nas quartas, o adversário era a LDU, que tinha a altitude de Quito a seu favor. Na primeira partida, depois de sair vencendo com o um gol de Jorge Wagner, o time comandado por Abel Braga sofreu uma virada e o jogo terminou em 2 a 1. No confronto decisivo, em Porto Alegre, graças aos gols de Rafael Sobis e Rentería, o Colorado fez 2 a 0 e seguiu adiante no torneio continental.
Depois de conquistar o mundo em dezembro de 2006, o Inter chegava à Libertadores de 2007 com o objetivo de manter o título e assim chegar ao bicampeonato. Os planos, no entanto, não deram certo. O clube gaúcho teve um desempenho ruim na primeira fase e não conseguiu a classificação para a etapa eliminatória. Naquele ano, no entanto, os comandados de Abel Braga atuaram contra o Emelec duas vezes e conseguiram duas vitórias. A primeira veio após uma goleada no estádio Beira-Rio. O último triunfo aconteceu no George Capwell: 2 a 1.
Três anos após o fiasco de 2007, o Inter retornava à principal competição sul-americana. Em 2010, os equatorianos que apareceram no caminho foram Emelec e Deportivo Quito. Diante dos "Elétricos" (apelido do Emelec), o Colorado, treinado por Jorge Fossati, venceu a partida de estreia por 2 a 1. No confronto de Guayaquil, as duas equipes não passaram do 0 a 0.
Diante do Deportivo Quito, o Inter foi ao estádio Atahualpa e arrancou um empate em 1 a 1. Na partida no Beira-Rio, que definiu a classificação, o Colorado goleou os equatorianos por 3 a 0, placar que colocou os argentinos do Banfield frente a frente com os gaúchos nas oitavas de final.
Nesta edição da Libertadores, o Inter voltou a encontrar o Emelec. Na primeira partida, os dois times empataram em 1 a 1 no estádio George Capwell.
