Os grupos prioritários para a SES são crianças maiores de 6 meses e menores de 5 anos, pessoas acima dos 60 anos, gestantes e mulheres até 45 dias após o parto, trabalhadores da saúde e indígenas. O índice de vacinação nas crianças foi o mais baixo dentre o grupo, com a meta alcançada em 264 municípios. Apenas em Porto Alegre foram aplicadas 478.706 doses aplicadas.
O Centro Estadual de Vigilância em Saúde (Cevs) recomendou aos municípios que extendam o público-alvo a trabalhadores de portos, aeroportos e fronteiras, envolvidos com a Copa, bem como funcionários que de órgãos que compõem a Comissão Estadual de Segurança Pública e Defesa Civil para Grandes Eventos, profissionais da rede hoteleira e turismo e taxistas.