O programa é desenvolvido e financiado em parceria com o Ministério da Educação. Para as universidades contempladas, o valor corresponde a 60% do total destinado ao custeio dos serviços em 2012. Outras 11 universidades ainda receberão repasse para manutenção de serviços.
O financiamento do REHUF é dividido em três blocos: custeio, compra de equipamentos e realização de obras e reformas. Em 2012, o repasse global, somente para custeio, deve chegar a R$ 270 milhões. Deste montante, R$ 101,5 milhões (40%) já foram transferidos para 45 instituições de ensino. Com a liberação dos R$ 117,3 milhões, o montante do recurso liberado para custeio é de 81% do total assegurado para 2012.
No total, os hospitais universitários contarão, neste ano, com o volume de R$ 585 milhões, R$ 85 milhões a mais do que em 2011.
