Cerca de 160 policiais federais cumprem 35 mandados de prisão preventiva, seis mandados de prisão temporária e 38 mandados de busca e apreensão em Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, São Paulo, Espírito Santo e Maranhão.
Em Mato Grosso, são cumpridos mandados de prisão em Cáceres, Pontes e Lacerda, Campo Novo dos Parecis e Cuiabá. Já em Mato Grosso do Sul, as prisões devem ser cumpridas em Campo Grande. Em Viana, no Espírito Santo, Pinheiro e Viana, no Maranhão, e em Ribeirão Preto, no interior de São Paulo.
No decorrer da investigação, que ocorreu durante um ano, seis pessoas foram presas em flagrante delito e apreendidos aproximadamente 390 kg de cocaína, além de material destinado à produção, preparação e transformação de drogas.
A Operação Noturnos recebeu este nome porque parte dos alvos entrarem com a droga no Brasil através de caminhada noturna, bem como enviarem o entorpecente para os outros Estados através de "mulas" que viajam somente à noite.