Durante o julgamento, o Ministério Público foi criticado pelos próprios ministros do STF, inclusive pelo relator, Joaquim Barbosa, que chegou a responsabilizar o órgão pela absolvição dos dois réus por causa de falhas na elaboração da denúncia. Em resposta às críticas, Gurgel disse nesta terça-feira que não houve erro por parte da acusação e que o STF optou por absolver Duda Mendonça e Zilmar Fernandes. Segundo Gurgel, o "Ministério Público não se considera absolutamente responsável pela absolvição."
